Transnationale Programme werden zentral, das heißt von einer Stelle, der <link>Verwaltungsbehörde, verwaltet und von einem <link technisches>Gemeinsamen Technischen Sekretariat unterstützt. Beide Stellen sind im Programm CENTRAL EUROPE bei der Stadt Wien angesiedelt. Unterstützt werden diese Stellen vom <link contact>Netzwerk der nationalen Contact Points.
In Österreich gibt es zudem das <link>Nationale Komitee, welches der österreichischen Positionierung in den Begleitausschüssen (MC – Monitoring Committee) dient.
Auf Programmebene sind zudem weitere Einrichtungen von Relevanz: Die <link>Bescheinigungsbehörde (CA – Certifying Authority) sowie die <link>Prüfbehörde (AA – Audit Authority).
Die Organisationsstruktur zur Abwicklung des Programms sieht wie folgt aus:
Fleischmarkt 1
A-1010 Wien
Tel.: +43 1 5353444
Fax: +43 1 5353444-54